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實時熒光定量PCR常見問題及解決方法

2022-07-27 17:12:19

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺

        熒光定量PCR實驗常見問題及其解決方法由普拉特澤生物為大家總結(jié)分享,普拉特澤生物表達(dá)檢測平臺專業(yè)承接熒光定量PCR實驗代做服務(wù),在實時熒光定量PCR的實驗操作中積累了大量的經(jīng)驗,同時也遇到了不計其數(shù)的問題,表達(dá)檢測實驗的技術(shù)在一次又一次實踐中總結(jié)了遇到各種常見問題的原因和解決方法。本文就跟大家一起來看實驗過程中出現(xiàn)頻率最高的一些問題:

        1、RNA得率低

        原因1:樣品裂解不完全

        解決:適當(dāng)選擇起始材料的量,加入合適體積的裂解液。

        原因2:勻漿不充分

        解決:減少材料的數(shù)量; 根據(jù)材料類型選擇合適勻漿方法; 組織樣本適宜切成小塊后,Trizol試劑中均質(zhì),充分裂解。

        原因3:用于分光光度分析的稀釋液PH值太低

        解決:使用TE(PH 8.0)作為稀釋液進(jìn)行讀數(shù)測定。

        2、RNA降解

        問題1:RNA酶污染

        解決:戴上手套操作,勤換手套; 耗材與試劑均應(yīng)作RNase-free處理; 操作中減少EP管的開蓋次數(shù)與時間。

        問題2:樣品處理不當(dāng)

        解決:新鮮組織收獲后,立即凍結(jié)在-70或液氮中; 也可以在Trizol試劑中均質(zhì)后,-70℃下儲存。

        3、Abs260/Abs280比值低

        問題1:酸性pH降低吸光度比率

        解決:使用TE緩沖液(pH 8.0)作為稀釋液進(jìn)行測定。

        問題2:水相被酚相污染

        解決:小心轉(zhuǎn)移上層水相,避免吸入中間相,可留少許上層相不吸取。

        4、DNA 污染

        問題1:Trizol加少了,造成DNA /核蛋白復(fù)合物與RNA水相分離不完全

        解決:適當(dāng)選擇起始材料的量,加入合適體積的裂解液。

        問題2:水相被苯酚相污染

        解決:小心轉(zhuǎn)移上層水相,避免吸入中間相,可留少許上層相不吸取。

        5、下游反應(yīng)中RNA表現(xiàn)不佳

        問題1乙醇或鹽類污染

        解決:溶解RNA之前,注意洗滌沉淀,并通過空離和風(fēng)干除去殘留。

        6、熔解曲線有雜峰

        問題1:引物二聚體

        解決:

        1提高退火溫度

        2降低引物濃度,甚至調(diào)整正向引物和反向引物的比例。 一般引物最終濃度設(shè)定為200 nM,但如有必要,可降低至60 nM

        3鎂離子的濃度最好在3 mM左右。 高于這個濃度,引物二聚體更易形成;

        4重新設(shè)計引物并評估它們的二聚化傾向。

        問題2:非特異性擴(kuò)增

        解決:重新設(shè)計引物并通過預(yù)實驗評估特異性。

        問題3:cDNA模板降解

        解決:模板避免反復(fù)凍融,可適當(dāng)分裝保存,每次取用一小管。

        7、無擴(kuò)增信號

        原因:低表達(dá),反轉(zhuǎn)錄,或定量儀器問題

        好啦!那實時熒光定量PCR實驗常見問題及其解決方法咱們就分享到這里啦!希望能幫到大家哦,如果您遇到了更多解決不了的問題或需要外包實時熒光定量PCR實驗,歡迎隨時留言哦~咱們下期見!



        

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