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很多人WB結(jié)果不好,卻沒懷疑過自己的膠選錯(cuò)了

2025-10-28 11:55:23

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)

Question:很多人WB結(jié)果不好,卻沒懷疑過自己的膠選錯(cuò)了(普拉特澤生物提供長期穩(wěn)定的wb實(shí)驗(yàn)外包服務(wù))

一、凝膠濃度對(duì)蛋白有哪些影響呢?




把聚丙烯酰胺凝膠想象成一個(gè)分子篩網(wǎng):


1)高濃度膠(如15%):網(wǎng)眼小,小蛋白能靈活穿梭,大蛋白則寸步難行

2)低濃度膠(如8%):網(wǎng)眼大,大蛋白可以自由奔馳,小蛋白卻可能“剎不住車”


選錯(cuò)濃度會(huì)怎樣?


1)膠太濃:大蛋白分離不開,擠成一團(tuán)

2)膠太?。盒〉鞍着艿锰欤苯印芭軄G”



二、到底應(yīng)該怎么選擇濃度膠呢?


濃度膠選擇技巧:



1)不確定時(shí)選10%:適合大多數(shù)常見蛋白(這也是我們常用的濃度膠


2)大蛋白用低濃度:更容易分離且轉(zhuǎn)膜更充分

3)梯度膠是神器:從上到下濃度遞增,一塊膠搞定不同大小蛋白



特殊分離膠濃度需要考量:


1)應(yīng)對(duì)超大或超小分子量蛋白


對(duì)于大于200 kDa的蛋白,比如200 kDa或280 kDa的蛋白,推薦使用6%或7% 的分離膠,并適當(dāng)延長電泳時(shí)間。


對(duì)于小于20 kDa的小分子蛋白或多肽,常規(guī)的Tris-甘氨酸系統(tǒng)分離效果可能不佳。這時(shí),Tris-Tricine緩沖系統(tǒng)的預(yù)制膠(例如16.5% 的濃度)是更好的選擇,它能更有效地分離2-40 kDa的小分子量蛋白。


2)使用梯度膠應(yīng)對(duì)寬范圍或不同大小的蛋白
如果需要分離的蛋白分子量分布很廣,或者想在同一塊膠上同時(shí)分析多個(gè)不同大小的蛋白,梯度膠(例如4-12% , 4-20% )會(huì)非常方便。它從膠頂?shù)侥z底的濃度是連續(xù)變化的,因此可以在同一塊膠上清晰地分離出分子量差異很大的蛋白。


三、經(jīng)驗(yàn)


由于我的研究課題涉及到的蛋白分子量在15-150kd范圍內(nèi),所以我常用的就是雅酶10%的一步法預(yù)混膠,下面給大家看看電泳的效果吧

??這是剛開始跑的時(shí)候


?? 這是快要結(jié)束的時(shí)候

、

四、我們WB時(shí)需要關(guān)注濃度膠的那些情況呢?

1.根據(jù)自己的目標(biāo)分子選擇對(duì)應(yīng)的濃度膠,保證蛋白電泳過程中順利下沉及分開,不懂時(shí)可以咨詢一下師兄師姐,特別是與他人蛋白kd數(shù)差距甚遠(yuǎn)時(shí)。 

 2.配膠時(shí)一定要注意添加手法,學(xué)姐一直推薦左右滑動(dòng)著加上下層膠,因?yàn)樵诓AО宓囊唤羌尤?,容易?dǎo)致配膠濃度不均,即使添加前已吹打混勻,添加完畢+插完梳子以后,將制膠架于實(shí)驗(yàn)桌上輕磕一下,保證分界線平齊。 

 3.配膠后凝固時(shí)間適當(dāng),學(xué)姐真的不建議提前配膠,盡量現(xiàn)配現(xiàn)用,學(xué)姐之前在北方,夏天冬天溫差不是特別大(因?yàn)楸狈接信瘹猓晕蚁奶旌投斓哪z時(shí)間都是固定的。但是學(xué)姐現(xiàn)在到南方了,冬天的時(shí)候氣溫低,凝膠時(shí)間就需要延長20-30min,或者多添加一些促凝劑,以便縮短凝膠時(shí)間。 

判斷濃度膠凝固知識(shí)點(diǎn):插梳子以后,玻璃板會(huì)多出一部分上層膠流在制膠架上,我們可以等待20-30min以后,將玻璃板拆卸下來,看看多余的膠是否凝好,若是呈膠條狀,則代表膠已凝好,可以電泳。

4.注意緩沖液系統(tǒng),分離小分子量蛋白(<20 kDa)時(shí),記得Tris-Tricine系統(tǒng)比常規(guī)的Tris-甘氨酸系統(tǒng)效果更好。 

  5.預(yù)制膠是很多同學(xué)的優(yōu)先選擇,因?yàn)榭梢怨?jié)省配膠時(shí)間,但是一定要注意預(yù)制膠的保存以及使用方法,否則可能會(huì)讓你浪費(fèi)更多的時(shí)間去試錯(cuò)。對(duì)于大分子量蛋白,有建議使用6%的分離膠,而小分子量蛋白則可選用16.5%的Tricine預(yù)制膠,常規(guī)分子量推薦10%的預(yù)制膠。

文源【醫(yī)學(xué)盛夏學(xué)姐】

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