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酵母四雜交

酵母四雜交系統(tǒng)的原理是在酵母雙雜交系統(tǒng)的基礎(chǔ)上改進(jìn)的,用來驗(yàn)證RNA與RNA互作分析;從本質(zhì)上來說,在質(zhì)粒構(gòu)建過程中就是比酵母雙雜交系統(tǒng)多了一個基因表達(dá)框。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

酵母四雜交系統(tǒng)的原理是在酵母雙雜交系統(tǒng)的基礎(chǔ)上改進(jìn)的,用來驗(yàn)證RNA與RNA互作分析;從本質(zhì)上來說,在質(zhì)粒構(gòu)建過程中就是比酵母雙雜交系統(tǒng)多了一個基因表達(dá)框。

從原理和技術(shù)路線上是將兩個已知的RNA結(jié)合蛋白分別與轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合domain(如LexA)和激活結(jié)構(gòu)域(activation domain)分別構(gòu)建融合蛋白。此外構(gòu)建兩個雜合RNA,各自含有二個不同的結(jié)合位點(diǎn),其中一個結(jié)合位點(diǎn)是與已知的RNA結(jié)合蛋白結(jié)合的頸環(huán)序列。當(dāng)RNA與RNA相互作用時可激活報(bào)道基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。

1、RNA結(jié)合蛋白選用噬菌體MS2被殼蛋白(MS2 coat protein),MS2 coat protein可識別RNA中的21nt的莖環(huán)序列,并與之有較高的親和力。

2、實(shí)驗(yàn)中需要用2個質(zhì)粒表達(dá)雜合RNA,一個含有MS2 coat protein結(jié)合位點(diǎn)、另一個含有RNA類型的轉(zhuǎn)錄激活標(biāo)簽m26。


【實(shí)驗(yàn)流程】



案例展示

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送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動物組織單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




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